As Ciências Biológicas fazem parte da história da UFSCar desde a criação da Universidade, em 1970, quando foi implantado o curso de Licenciatura em Ciências, hoje extinto. O Centro de Ciências Biológicas e da Saúde, no Campus São Carlos, foi criado em 1972, com a implantação do curso de graduação em Ciências Biológicas.

O Centro abrigou um dos dois primeiros programas de pós-graduação da UFSCar, o de Ecologia e Recursos Naturais, criado em 1976. Hoje, as Ciências Biológicas estão presentes em todos os campi da UFSCar, em Araras, Sorocaba e, também, no novo campus de Lagoa do Sino, no município de Buri.